BIODIVERSITY SAMPLING PROTOCOL VIA PASSIVE ACOUSTIC MONITORING

Authors

Keywords:

Automatic detection, soundscape, bioacoustics, populations, communities, sampling design.

Abstract

Passive acoustic monitoring (PAM) is a non-invasive method that allows the assessment of biodiversity and the monitoring of ecological processes and environmental impacts. The recordings capture biological, geophysical, and anthropogenic sounds, enabling analyses of the soundscape, detection of organisms, and quantification of anthropogenic impacts such as noise pollution and hunting. With technological advances and the use of standardized methods like RAPELD, PAM has the potential to expand comparative studies and support conservation efforts. Here we present a protocol for the use of passive acoustic monitoring in RAPELD systems. We recommend that at least one recorder be used and installed at the center of the RAPELD plot (~125 m). The recording configurations, as well as the number of days and sampling times, will depend mainly on the nature of the sounds to be sampled (audible or ultrasonic) and on the equipment chosen for sampling. In this protocol, we present some options aimed at the standardization and comparability of data. Additionally, we suggest some best practices for conducting data collection, as well as for the subsequent storage and sorting of the data. Using this protocol, it would be possible to access information about populations and communities of various acoustically active organisms, such as insects, anurans, birds, bats, and primates, in addition to soundscapes.

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Author Biographies

Tainara Venturini Sobroza, Departamento de Biologia, Universidade Federal do Amazonas. Avenida General Rodrigo Otávio, 1200, CEP 69067-005. Manaus - AM, Brasil. Email: tv.sobroza@gmail.com

Doutora em Ecologia pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA).

Anderson Saldanha Bueno, Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia Farroupilha, Júlio de Castilhos - RS, Brasil

Doutor em Ciências Ambientais pela University of East Anglia. Instituição: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia Farroupilha

Anaís Rebeca Prestes Rowedder

Mestre em Ecologia pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Bolsista de Pesquisa no Grupo de Ecologia de Vertebrados Terrestres, Instituto Mamirauá.

Gabriel Salles Masseli, Programa de Pós-graduação em Ecologia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus - AM, Brasil

Doutorando em Ecologia pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA).

Giulliana Appel, Instituto Tecnológico Vale, Belém - PA, Brasil.

Doutora em Ecologia pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Pesquisadora Pós doutoranda do Instituto Tecnológico Vale.

Gustavo de Melo Martins, Programa de Pós-graduação em Ecologia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus - AM, Brasil; Department of Biological Sciences and Museum of Natural Science, Louisiana State University, Baton Rouge - LA, EUA.

Mestre em Ecologia pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA).

Hevana S. Lima, Laboratório de Ecologia & Evolução de Aves, Departamento de Zoologia, Universidade Federal de Pernambuco, Recife - PE, Brasil.

Doutora em Biologia Animal pela Universidade Federal de Pernambuco, Pesquisadora do PPBio Semiárido RABECA.

Igor Luís Kaefer, Departamento de Biologia, Universidade Federal do Amazonas, Manaus - AM, Brasil

Professor Associado no Depto de Biologia, Universidade Federal do Amazonas (UFAM).

João Vitor Chaves dos Santos, Programa de Pós-graduação em Conservação e Uso de Recursos Naturais, Universidade Federal de Rondônia, Porto Velho - RO, Brasil.

Biólogo, mestrando em Conservação e Uso de Recursos Naturais (PPGReN), Universidade Federal de Rondônia (UNIR).

Jonathan Ramos Ribeiro, Laboratório de Ecologia & Evolução de Aves,Departamento de Zoologia, Universidade Federal de Pernambuco, Recife - PE, Brasil

Doutorando em Etnobiologia e Conservação da Natureza, Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE).

Lina Paola Acosta Rodriguez, Programa de Pós-graduação em Conservação e Manejo de Recursos Naturais, Universidade Estadual do Oeste do Paraná, Cascavel - PR, Brasil.

Bacharel em Ciências Biológicas - Ecologia e Biodiversidade pela Universidade Federal da Integração Latino-Americana (UNILA), atualmente Mestranda no programa de Pós graduação em Conservação e Manejo de Recursos naturais da Universidade Estadual do Oeste do Paraná, UNIOESTE, Pesquisadora do Laboratório de Ecologia de Metacomunidades.

Luciana Moraes Costa, Laboratório de Ecologia de Mamíferos, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-graduação em Ecologia e Evolução, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro - RJ, Brasil.

Bióloga, Doutora em Ecologia e Evolução pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro, diretora executiva da empresa Piper 3D - Pesquisa, Educação e Consultoria Ambiental.

Luciano Nicolas Naka, Laboratório de Ecologia & Evolução de Aves, Departamento de Zoologia, Universidade Federal de Pernambuco, Recife - PE, Brasil.

Professor Associado no Departamento de Zoologia e Curador da Coleção de Aves da Universidade Federal de Pernambuco (UFPE). Mestrado em Ecologia Tropical pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia e doutorado em Ecologia, Sistemática e Evolução pela Louisiana State University (EUA). Já atuou como professor visitante nas universidades de Harvard (EUA) e James Cook (Australia).

Maria Alice S. Alves, Departamento de Ecologia, Instituto de Biologia Roberto Alcantara Gomes, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro - RJ, Brasil.

Ph.D, Professora Titular do Departamento de Ecologia, Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ).

Neucir Szinwelski, Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Estadual do Oeste do Paraná, Cascavel – PR, Brasil.

Doutor em Entomologia pela Universidade Federal de Viçosa, Professor associado da Universidade Estadual do Oeste do Paraná

Paulo Estefano Dineli Bobrowiec, Programa de Pós-graduação em Ecologia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus - AM, Brasil; Instituto Tecnológico Vale, Belém - PA, Brasil.

Pesquisador pós-doutorando pelo Instituto Tecnológico Vale (ITV) e docente do Programa de Pós-graduação em Ecologia do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA). Doutor pelo Programa de Pós-graduação em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva do INPA, doutor pelo Programa de Pós-graduação em Zoologia da Universidade Federal do Amazonas (UFAM), mestre pelo Programa de Pós-graduação em Ecologia do INPA e Biólogo formado em licenciatura e bacharelado pela Universidade Federal de Uberlândia (UFU).

Rafael Saint Clair, Departamento de Ecologia, Instituto de Biologia Roberto Alcantara Gomes, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro - RJ, Brasil.

Mestrado em Ecologia e Evolução pela Universidade Estadual do Rio de Janeiro (UERJ).

Renato Daniel Senden, Laboratório de Ecologia de Mamíferos, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-graduação em Ecologia e Evolução, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro - RJ, Brasil.

Mestrado em Ecologia e Evolução pela Universidade Estadual do Rio de Janeiro (UERJ), Bolsista DTI-B no programa PPBio Mata Atlântica.

Sâmia Letícia Reolon da Cruz, Laboratório de Biodiversidade e Ecologia Funcional, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus - AM, Brasil.

Mestre em Biodiversidade Animal pela Universidade Federal de Santa Maria, Bolsista DTI do PPBIO Ecossistemas

Tomaz Nascimento de Melo, WildMon, Dale - TX, EUA.

Doutor em Zoologia pela Universidade Federal do Amazonas, Cientista de Biodiversidade na companhia WildMon.

Thiago Bicudo, Grupo de Pesquisa em Ecologia de Vertebrados Terrestres, Instituto de Desenvolvimento Sustentável Mamirauá, Tefé, AM, Brasil.; WildMon, Dale - TX, EUA.

Doutor em Ecologia pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Ecólogo Quantitativo na WildMon, Pesquisador associado do Grupo de Pesquisa em Ecologia de Vertebrados Terrestres, Instituto de Desenvolvimento Sustentável Mamirauá.

Published

2025-08-19