PROTOCOL FOR FUNGI SAMPLING IN RAPELD PLOTS

Authors

Keywords:

Amazon, Funga, conidial fungi, entomopathogenic fungi, wood fungi, Atlantic Forest

Abstract

Fungi are essential organisms for the functioning of ecosystems, playing crucial roles in decomposition, nutrient cycling and establishing symbiotic relationships with various organisms. This paper presents standardized protocols for sampling fungi in RAPELD plots, covering macrofungi, decomposer microfungi and entomopathogenic fungi. The methods described aim to facilitate studies of biodiversity, ecology and biotechnological potential of Brazilian fungi. For decomposer fungi, the protocol details collection techniques in terrestrial and aquatic environments, followed by laboratory procedures for isolation and identification. Sampling macrofungi involves active searching in a defined area, with emphasis on photographic documentation and proper preservation of the samples. For entomopathogenic fungi, a systematic search for infected insects is described, with guidelines for collection and preservation. The methods are designed to be economical and applicable in places with limited resources. The implementation of these protocols in the Amazon biome, using the RAPELD method, aims to facilitate collaborative data integration throughout the biome. The results are expected to significantly expand understanding of fungal diversity, distribution and ecology in different phyto-physiognomies of the Amazon, as well as in other biomes. In addition, the protocols make it possible to collect specimens for biotechnological studies, enabling the discovery of new bioactive compounds, industrial enzymes and biological control agents. The standardization of sampling techniques also facilitates comparisons between different regions over time, contributing to a more comprehensive understanding of the dynamics of fungal communities and their role in ecosystems

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Author Biographies

Kely da Silva Cruz, Centro de Estudos Integrados da Biodiversidade da Amazônia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. Avenida André Araújo, 2936, CEP 69067-375. Manaus, AM, Brasil. Email: cruzsk@outlook.com .

Doutora em Biodiversidade (Rede Bionorte), Pesquisadora do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia e integrante do grupo de pesquisa do Centro de Estudos Integrados da Biodiversidade Amazônica (CENBAM/PPBio).

Douglas de Moraes Couceiro, Laboratório de Biologia Molecular e Genômica, Embrapa Amazônia Ocidental, Manaus-AM, Brasil

Doutor em Biodiversidade e Biotecnologia (Rede Bionorte), Pesquisador na Embrapa Amazônia Ocidental

Rafaela Saraiva Peres, Centro de Estudos Integrados da Biodiversidade da Amazônia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. Manaus, AM, Brasil.

Mestre em Botânica pela Universidade Estadual de Feira de Santana, Integrante do Grupo de Pesquisa de Fungos do Centro de Estudos Integrados da Biodiversidade Amazônica (CENBAM/PPBio).

Rafaela Araújo Ferreira Gurgel, Coordenação de Dinâmica Ambiental (CDAM), Grupo MAUA - Ecologia, Monitoramento e Uso Sustentável de Áreas Úmidas, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Manaus, AM, Brasil.

Mestre em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) e integrante no Grupo de Pesquisa em Ecologia, Monitoramento e Uso Sustentável de Áreas Úmidas (MAUA-INPA)

Flavia Rodrigues Barbosa, Universidade Federal de Mato Grosso, Acervo Biológico da Amazônia Meridional (ABAM), Sinop, MT, Brasil.

Doutora em Ciências - Botânica pela Universidade Estadual de Feira de Santana, Professora da Universidade Federal de Mato Grosso

Luiz Fernando Scatola, Universidade Federal de Mato Grosso, Acervo Biológico da Amazônia Meridional (ABAM), Sinop, MT, Brasil.

Graduado em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado de Mato Grosso. Aluno de mestrado do Programa de Pós-graduação em Ciências Ambientais

Patrícia Oliveira Fiuza, Universidade Federal da Bahia, Salvador, BA, Brasil.

Doutora em Ciências - Botânica pela Universidade Estadual de Feira de Santana, Professora da Universidade Federal da Bahia

Heloysa Farias da Silva, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, RN, Brasil.

Mestre em Sistemática e Evolução. Aluna de doutorado do Programa de Pós-graduação em Sistemática e Evolução

André Santos de Aquino Alves do Monte, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, RN, Brasil.

Tecnólogo em Investigação Forense e Perícia Criminal. Bacharelando em Ciências Biológicas

José Aragão Cardoso-Neto, Programa de Pós graduação em Zoologia, Universidade Federal do Amazonas, Manaus, AM, Brasil.

Mestre em Diversidade Biológica pela Universidade do Amazonas, servidor do Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Amazonas-IFAM (campus Maués).

Fernando Sarti Andriolli, Programa de Pós-Graduação em Entomologia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus, AM, Brasil.

Doutor em Ciências Biológicas (Entomologia) pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), onde também atua como pesquisador.

Fabricio Beggiato Baccaro, Departamento de Biologia, Universidade Federal do Amazonas, Manaus, AM, Brasil.

Doutor em Ecologia pelo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Professor Adjunto na Universidade Federal do Amazonas

Gilvan Ferreira da Silva, Laboratório de Biologia Molecular e Genômica, Embrapa Amazônia Ocidental, Manaus-AM, Brasil

Doutor em Microbiologia pela Universidade Federal de Viçosa, Pesquisador da Embrapa Amazônia Ocidental

Helena Godoy Bergallo, Departamento de Ecologia, Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ), Rio de Janeiro, RJ, Brasil.

Doutora em Ecologia pela Universidade Estadual de Campinas, Professora Titular na Universidade do Estado do Rio de Janeiro

Elisandro Ricardo Drechsler-Santos, Departamento de Botânica, Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC), Campus Trindade, Florianópolis, SC, Brasil.

Doutor em Biologia de Fungos pela Universidade Federal de Pernambuco, Chair do IUCN SSC Brazil Fungal Specialist Group, Professor Associado da Universidade Federal de Santa Catarina

William Ernest Magnusson, Centro de Estudos Integrados da Biodiversidade da Amazônia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. Manaus, AM, Brasil.

Doutor em Ciências Biológicas pela Universidade de Sydney. Pesquisador do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia

Published

2025-08-19